2004
年度项目
1
、省教育厅项目：高师院校面向基础教育课程改革人才培养改革研究与探索(汉语言文学)；主持人：陈明刚；经费：0.5万元。学校配套经费：0.5万元
2
、地区科技计划项目：贵州毕节裂腹鱼类资源的保护与开发利用；主持人：陈永祥；经费：8万元
3
、地委宣传部重点理论研究课题：对毕节地区统筹城乡经济社会发展的思考；主持人：赵发忠；经费：0.3万元
4
、地委宣传部重点理论研究课题：毕节地区县、乡财政困难成因分析及对策探讨；主持人：王德学；经费：0.3万元
5
、地委宣传部重点理论研究课题：如何协调毕节试验区能源开发的速度与资源、环境的关系；主持人：刘雷；经费：0.3万元
6
、地委宣传部重点理论研究课题：毕节地区如何统筹城乡经济建设，走新型工业化道路；主持人：沈晓夏；经费：0.3万元
7
、校级课题：贵州疣螈生理生化特性研究；主持人：胡思玉；经费：0.5万元
8
、校级课题：墨经辞典；主持人：张仁明；经费：0.9万元
9
、校级课题：毕节学院网络办公系统；主持人：王朴；经费：0.5万
2005
年度项目
1
、科技部国家攻关计划“西部开发”重大项目：贵州毕节试验区生态建设关键技术研究与应用；主持人：陈永祥；经费：300万
2
、教育部“民族语文规范化信息化”项目：贵州毕节试验区生态建设关键技术研究与应用；主持人：陈 英 ；经费：42万
3
、校级课题：威宁趾沟蛙生态—生物学研究；主持人：王延斌；经费：0.6万
4
、校级课题：贵州韭菜坪石林形态调查研究；主持人：莫世江；经费：0.6万
5
、校级课题：半夏组织培养快繁技术研究；主持人：彭晓馨；经费：0.5万
2009
年度项目
1
、校级项目：《猪常温保存精液稀释液配方的改进》；主持人：王棋文；经费：0.3万
2
、校级项目：《山羊KIFI基因的克隆及其与产绒性能相关性研究》；主持人：李丽娟；经费：0.4万