毕节学院生物专业始办于1984年。根据毕节地区当时中学生物教师比较缺乏的实际，原毕节师范高等专科学校农村职业中学师资系（成立于1984年）及时调整办学思路和方向，转向培养中学生物教师，于1986年开办三年制生物教育专科专业。

2002年，原毕节师范高等专科学校与贵州师范大学联合办学，生物科学作为联合办学专业招收四年制师范专业本科生，2003年继续为贵州师范大学招生培养。两年分别为贵州师范大学培养两届本科毕业生共计71人。这为开办生物本科专业积累了一定的办学经验。

2005年，原毕节师范高等专科学校和原毕节地区教育学院经国家教育部批准合并成立毕节学院，原农村职业中学师资系更名为环境与生命科学系，生物科学本科专业经贵州省教育厅报国家教育部高等教育司批准开设，并于当年开始招生。截止2011年，共招生338人，已有先后3届学生毕业，共计99人。

在2009年的学位评估中，生物科学专业通过贵州省学位办的学位评估，办学水平和质量得到了一次全面检验。